|
|
Accession Number |
TCMCG019C01835 |
gbkey |
CDS |
Protein Id |
XP_022933688.1 |
Location |
complement(join(9780877..9780951,9781424..9781492,9782551..9782628,9782733..9782799,9782937..9783041,9783121..9783647,9783729..9783934,9784301..9784934,9786150..9786201,9787126..9787787,9787918..9788109,9788448..9789170,9789255..9789498,9790317..9790457,9790550..9791781,9792083..9793195,9793561..9793629)) |
Gene |
LOC111441022 |
GeneID |
111441022 |
Organism |
Cucurbita moschata |
|
|
Length |
2062aa |
Molecule type |
protein |
Topology |
linear |
Data_file_division |
PLN |
dblink |
BioProject:PRJNA418582 |
db_source |
XM_023077920.1
|
Definition |
E3 ubiquitin-protein ligase PRT6-like [Cucurbita moschata] |
CDS: ATGGACGATATGGATACTTGTTCGCCTTCTGAATCTGCTCCACTTAAGCCTCGTGATCGAATAGTGCTGCGGCTTGCTGTACTTGGAGTTCCCGATGAGCTATTGGATCAGCTTCAACCTGGTTTAGTTTCTTTTGTCAAGGACAACAAGTATCTGATACCGCAGCTGGTATCTGTAATTTTGCCTACTGATGTCGAAGTGGTAAAAGCTATACGAGAAGCTAAAGCAGGGTCCAAAAAATCTGTGACGGGCCCAACCATGAAAAATCAATTCCGTGAGAGCATGACGTGGTTACAGTGGTTGATGTTTGAAGGTGAACCAGCTTCTACTCTGAAGAACCTGTCAAAAATGAGTGTTGGCCAGCGTGGTGTATGTGGTGCTGTTTGGGGACATAATGATATAGCTTACAGGTGCCGAACTTGTGAACACGACCCAACTTGTGCAATTTGTGTCCCTTGCTTTCAAAGTGGGAATCATAAGGACCACGATTACTCCATAATTCATACAGGTGGTGGTTGCTGCGATTGTGGCGATGTGACAGCATGGAAGCGGGAAGGTTTTTGCTCAAAGCATAAAGGTGCAGAACAGATACAACCACTCCCCGAGGAATTTGTTAAATCTGTAGAGCCTATACTCGATGTACTCTTCACTTGTTGGAAAAACAAACTCTTATCTGCTGAATATATCAGTGTGGAAGACTCTAAATTGAGTGATCATGTTACAGAGCATAAAAAGGTTGCAAATGAGTTAACATTTGCTATGGTTGAGATGCTTTTAGACTTCTGCAAGTACAGTGAAAGCTTACTTAGTTTTGTTTCAAAGAGGGTGATTTCTTCAGCTGGCTTATTGGATGTTTTGGTGGGGTTGGAGAGGCTATTAACTGAAAGTGTAGTGAAGAAAGTCCACGAGTTACTTCTTAAATTGCTAGGAGAACCTGTATTTAAGTACGAATTTGCGAAAGTTTTTTTGAATTATTATCCAAATGTTATCAGTGAAGCAATAGAAGACAACAGTGACCACGTTCTGAAAAAGTATCCACTATTGCCAACTTTCTCAGTGCAAATATTCACTGTTCCCACACTTGCTCCTCGTTTGGTGGAGGAAATGAACTTATTGTCCATCCTTTTGGGATGTTTAGAAGATATATTCATTTCTTGTTCAAGCAAAAATGGGCGCTTGCAGGTTATAAAGTGGAGTAATTTGTGTGAAACCACGATTCGTGTAGCTGAAGATGTTAGATTTGTCATGAGTCATGCTGTAGTGCCCAGATATGTGATCTATGAGCAGCAAGATATTCTAAGAACTTGGTTGAGACTGCTTACTTTTGTGCAAGGCATGGATCCTCAGAAGAGAGAAACAGGCATCCATATAGAAGAAGAAAATGAAAATATACATTTACCTTTTGGTTTAGATCATTCTGTTGCCAACATCCACGCTTTATTGGTGAATGAAGCATTTTCTGCTGCTAGTAGTAGTAGCAGCAGTAGTGAAGATACAGCTGATGCAATGTCTTTCCAAACGTACAAGCCGAATCCAGATGACATAGATAGTGTTAGATATGCTAAAGTAGGACGTTTATCACAGGAAAGTGCTGCATGTAGTTTGTTGGGAAAGAGTACTACATCCACTTCTGCATCAAAAGTTGATGAAGTTCGTTTAGATACAATTTCACCGACTATTATGTGGCTGACTTACGAGTGCTTGAAGACCATTGATAGTTGGTTGGGAACAGAAAATGCATCTGGAGGTATTTCAAACATGTTTGATGAATACATTCGCATGACCCCTATTTGCATATTTTATTCATCTAGAAAAGCTTCTGCCCTGGAACCAAAGAAAATGTCATCTAAGATGGGGAAAGGTAAATTTATTTTAGAGAAGCTTGCTAGAAGAAGCAAAGACCATAATAGCCAATATTCCTCACGTATGTACAGTGGCCTTCCAATGAGTATTGACATTGAGCATGGTATAAGTCATGGAGAAGACAACCAATTGATGGATATGACTAATGATACAGTTACTGTTGAGGACTATGCCATGGAGATTGATGCACTAGATTATCTAAGCATGTCTTCTTGGCCAAACATAGTTTTTGATGTTAGTTCACAAGACATATCCATTCACATCCCATTACATCGACTGCTTTCCTTGCTTTTACAGAAGGCATTGAGAAGCTGTTTTAGTGAATCTGTGGTGACAAATGCAACAGGTGCCAGTTCCTCAAATTTGTCATCTGAATCTGTGGACTTCTTTAAAAGTGTTCTTACAGACTGTCATCCATATGGTTTTTCTTCATTTGTAATGGAGCATCCTCTACGCATTAAAGTTTTTTGTGCTGAGGTTAATGCTGGAGCATGGCGGAGGAATGGAGATGCAGCCCTATTATCTTGTGAGTTGTATCGATCAGTCCGCTGGTCAGAACAATGTCTGGAGCTTGATCTCTTTTTGTTGCAGTGCTGTGCGGCAATGGCTCCACCTGATTTTTATGTCAGTAGAATTTTAGAACGCTTCCAGCTATCAGACTATCTTTCCCTAAATGTTGAAAGCCCTAGTGAGTATGAGCCTATTTTAGTTAAAGAGATGCTCACATTAATCATACAAGTAGTCAATGAAAGGAGATTTTGTGGACTCACTGTAGCCGAAAGCTTGAAGAGAGAGTTGATTTACAAGTTAGCAATTGGAGATGCTACTCATAGTCAACTGGTGAAAGCACTTCCTCGTGATCTTTCCAAGTGTGATCAGCTACAGGAAATTCTAGATACAATTGCTGTGTATTCCAATCCCTCTGGATTTAATCAGGGGATGTATTCTTTACATTGGAAATATTGGAAAGAATTGGATCTGTACCACCCTCGTTGGAGTTTACGGGATCTGCAGATTGCTGAAGAACGATACTTGAGGTCGTGTGGTGTCTCTGCTTTGACCTCACAGCTACCTAAATGGACTAAAATTTATCCTCCTTTTAGAGGATTGGCTAGAATAGCTACTTGTAAAACAGTCCTTCAAATTGTTCGTGCTGTTCTGTTTTACTCTGTTTTTACTGAGAAATCAACTAAATCACGCGCCCCAGATAGTGTCCTGTTAACTGCACTGCACTTGCTAGCGTTGGCATTGGACATTTGCTTTATGCAAAAGGAATCGAGTAATCAATCGCTTTATGCTCGAGATTCTATTCCTTTGCTTCTATTTGCTGATGAAGAAATTGATGAGGGTTTGACATGTGGTTTCGGCAGACAAAGCTTGTTATCTCTTCTTATTTTGTTAATGAAAATGCACAAGGAGGAAGGTCGAGAAAACTTATTGCAGGCTGGAAGTTGCAACCTATCCTCTCTGGTTGGAAGCTTGTTGAAGAAATTTTCAGAGATTGATTCTTGTTGCATGGGCAAACTTCAGCAACTTGCGCCTGAAATTCTTGGTTACCGTACACAGTCTGTGCCAAGTAGTAATACTAATAGCCCAAGTGGAACTTCTGATAGTGAGAAGCGGAAGGCCAAGGCTCGAGAGAGACAGGCTGCTATATTGGAAAAAATGAGAGCTGAGCAATCTAAATTTTTGGCTAGTGTTGATGCCTCTATGGATGAATATGATACAGAGATTGGGCAGCAGTCTGAGAAGCCCAATGTCAGTGATAGTGCGGAACAGTCTGAAACTGTTTGCTCGCTTTGCCATGATTTTAGTTCCAGTGTTCCTATTTCTTTTCTGATTCTTCTGCAGAAATCAAAGCTTGTGAGTTTAATTGATCGAGGTCCTGTGTCATGGGATCAACCTTACTGGAGAGATGAACATGCCTCAACAATGTCAAAAAGGGACCTTGATCAATCTAGGTTATGCACCTCCTCTGCAGGTTCAGGAGTGATTTCATCGCCGCAGTTAGCTGAGCTCATTCAGAACGCAGTTAGAGAATATGCAAATCATGGATTACCTGGGGAAGTTGGCGCTTTTCTGGATTTTGCCAAGTCTCATTTTCCTCCTTTACGAAACATCCAAGGGCCTGGTACTTCAAATGTTAAAGGAGAAAAAATAATATTCAGCTATGATAAGCTGGAAGAGGACATCTATTTATCCGTTCGAAAAGACATGCATGATACTGTACATTCTAAATTAAATGAGAACGAAATTTTTTCTGAAGTTGTAAGTGGAGAAGATACTAAGTCTGTGCTGCATGTAAAATTTCTAGCTGCCCTATCAAGAGAGCTGGCAGAAAATCATTCAACTTCTGAAAGTGCTCATGACGTTCCCAGGCTGATAGGATCTTTGCAGCCTGCCGCATTTAATGAAATTGGACCCACAGATTGTGATGGAATTTATCTTTCTTCTTGTGGGCATGCTGTGCATCAAGGATGTCTTGATCTATACTTATCTTCTTTGAAGGAAAGGTTTGCTCGAAGAATTGTATTTGAAGGAGGGCATATTGTTGATCCTGAGAAGGGAGAATTTTTGTGCCCAGTCTGCAGACGCCTTGCAAATTCCACTTTGCCTGCATTTCCTAGGGAAACTCAAAAGATTTGGAACCCGTCAATGTGTTCAGTTTGGAGTTTATCACATGTTTCAGATCATCTTAGCAAACCAAGTGAAAAAGTGAATCCACTTTATGTTCAGCAAGCAGTGGCTCTCCTTAAATCGACAGCTAAGGCTGTTGGGAAGAATAAAGTTCTTACAGATGTTTCTGTACATAGACTTAGGAAAGTGAATTGCAATCTCGAAGCTGTGTCCCTTGTTCTGTCTAAGTTATACTTTTCTGGGAAACATGATAAGTTAATTAGCTCCTCCAGGGCTAATCCATCAATTCTTATGTGGGACACTCTCAAGTATTCCATCATATCAATGGAAATTGCTGCTCGTAGTAAGACTGATATGAATCTCAATATTGGCCATAATACCTTGTATAAGGAGCTTAAAAGTTCGGGTGGTTTTATATTGTCATTATTGCTAAAAGTGATACAAAGCGTCAAGTGTGAGGATTCTCTCCTTATGCTTCAAAGATTTTGTGGTATTCAAAGGTTTGCAGATTCCATATGCTCTGGAATTTGCAATGAAGATGCTATTAACTCTTGTGGACGAGGTATCCTCCACATCTTGACCAGCCTTCGTGTGGAATTGCCACAATTTGATATCCAGTTTTTGAGTCGAGGATCTGATCCTGTTCTTACCCATGACCCATTTGCATCATTGATGTGGGTACTCTTTTGTCTTCCTTTCCCCTTCTTATCATGCAAGGAATCGTTGCTTACCTTTGTGCATATGTTCTACCTAGTTTCTGTGGCCCAGGCTATAATTACATCTTGCATCAAGTACGAGGGCAAGGTAGATGGGCTGGGTTCTAGTGATTGCTTGATTGCTGATATTTGCAAAATTATGGGAGAGTCTGAATATGCTCGATGGTATTTTGTTTCAAATTACACAGAGCCGTCTTGTAATGTCAAGGATATGATACGTAGCTTGACTTTCCCTTATCTTCGGAGATGTACACTACTTTTAAAAGTACTAAATTCTTCTGCACAAGGGCCAATTTTTGATGGAGAAACTGCTTTGGGAACATGTCTTGCCGGTGACAACATGATTGACAACATCGCACTGGAGATCAATGAAATCGATAAGCTTGAGAAAATGTTTGAGATCCCTCCATTGGATGCTGTTATCAAGGATGGAGCCTCACGGTCACTTGTTTGGAAATGGTTTTGTCATTTTAATAAAGAATTTGAGTTTCAGATGTCTAAAAATATAATGCACTGCACACCTGCAGTACCTTTTCAATTAATTCATTTACCTCATGTTTACCACGATCTATTGCAGAGATACATAAAGAAGAGATGCCCTGACTGCAAACATGTTATTGATGATCCTGCATTATGCCTACTATGTGCTAGACTGTGCTCTCCAAGCTGGAAATCATGTTGCAGGGAAAGTGGATGCCAAGCTCATGCAAATATCTGTGCTGCCGGTACTGGTGTATTTTTGCTGATTAGGAGGACGACAATTCTACTGCAGAGATCTGCACGTCAGTCTCCTTGGCCATCGCCTTATTTGGATGCTTTTGGTGAGGAGGATATTGAAATGCGTAGAGGAAAACCATTGTATTTGAATGAAGAGCGTTATGCTGCCCTATCATATATGGTTGCTTGTCATGGTCTTGATCGAAATTCAAAGGTTCTAGGCCAGACTACAATTGGGTCTGTCTTCGTGATTTAA |
Protein: MDDMDTCSPSESAPLKPRDRIVLRLAVLGVPDELLDQLQPGLVSFVKDNKYLIPQLVSVILPTDVEVVKAIREAKAGSKKSVTGPTMKNQFRESMTWLQWLMFEGEPASTLKNLSKMSVGQRGVCGAVWGHNDIAYRCRTCEHDPTCAICVPCFQSGNHKDHDYSIIHTGGGCCDCGDVTAWKREGFCSKHKGAEQIQPLPEEFVKSVEPILDVLFTCWKNKLLSAEYISVEDSKLSDHVTEHKKVANELTFAMVEMLLDFCKYSESLLSFVSKRVISSAGLLDVLVGLERLLTESVVKKVHELLLKLLGEPVFKYEFAKVFLNYYPNVISEAIEDNSDHVLKKYPLLPTFSVQIFTVPTLAPRLVEEMNLLSILLGCLEDIFISCSSKNGRLQVIKWSNLCETTIRVAEDVRFVMSHAVVPRYVIYEQQDILRTWLRLLTFVQGMDPQKRETGIHIEEENENIHLPFGLDHSVANIHALLVNEAFSAASSSSSSSEDTADAMSFQTYKPNPDDIDSVRYAKVGRLSQESAACSLLGKSTTSTSASKVDEVRLDTISPTIMWLTYECLKTIDSWLGTENASGGISNMFDEYIRMTPICIFYSSRKASALEPKKMSSKMGKGKFILEKLARRSKDHNSQYSSRMYSGLPMSIDIEHGISHGEDNQLMDMTNDTVTVEDYAMEIDALDYLSMSSWPNIVFDVSSQDISIHIPLHRLLSLLLQKALRSCFSESVVTNATGASSSNLSSESVDFFKSVLTDCHPYGFSSFVMEHPLRIKVFCAEVNAGAWRRNGDAALLSCELYRSVRWSEQCLELDLFLLQCCAAMAPPDFYVSRILERFQLSDYLSLNVESPSEYEPILVKEMLTLIIQVVNERRFCGLTVAESLKRELIYKLAIGDATHSQLVKALPRDLSKCDQLQEILDTIAVYSNPSGFNQGMYSLHWKYWKELDLYHPRWSLRDLQIAEERYLRSCGVSALTSQLPKWTKIYPPFRGLARIATCKTVLQIVRAVLFYSVFTEKSTKSRAPDSVLLTALHLLALALDICFMQKESSNQSLYARDSIPLLLFADEEIDEGLTCGFGRQSLLSLLILLMKMHKEEGRENLLQAGSCNLSSLVGSLLKKFSEIDSCCMGKLQQLAPEILGYRTQSVPSSNTNSPSGTSDSEKRKAKARERQAAILEKMRAEQSKFLASVDASMDEYDTEIGQQSEKPNVSDSAEQSETVCSLCHDFSSSVPISFLILLQKSKLVSLIDRGPVSWDQPYWRDEHASTMSKRDLDQSRLCTSSAGSGVISSPQLAELIQNAVREYANHGLPGEVGAFLDFAKSHFPPLRNIQGPGTSNVKGEKIIFSYDKLEEDIYLSVRKDMHDTVHSKLNENEIFSEVVSGEDTKSVLHVKFLAALSRELAENHSTSESAHDVPRLIGSLQPAAFNEIGPTDCDGIYLSSCGHAVHQGCLDLYLSSLKERFARRIVFEGGHIVDPEKGEFLCPVCRRLANSTLPAFPRETQKIWNPSMCSVWSLSHVSDHLSKPSEKVNPLYVQQAVALLKSTAKAVGKNKVLTDVSVHRLRKVNCNLEAVSLVLSKLYFSGKHDKLISSSRANPSILMWDTLKYSIISMEIAARSKTDMNLNIGHNTLYKELKSSGGFILSLLLKVIQSVKCEDSLLMLQRFCGIQRFADSICSGICNEDAINSCGRGILHILTSLRVELPQFDIQFLSRGSDPVLTHDPFASLMWVLFCLPFPFLSCKESLLTFVHMFYLVSVAQAIITSCIKYEGKVDGLGSSDCLIADICKIMGESEYARWYFVSNYTEPSCNVKDMIRSLTFPYLRRCTLLLKVLNSSAQGPIFDGETALGTCLAGDNMIDNIALEINEIDKLEKMFEIPPLDAVIKDGASRSLVWKWFCHFNKEFEFQMSKNIMHCTPAVPFQLIHLPHVYHDLLQRYIKKRCPDCKHVIDDPALCLLCARLCSPSWKSCCRESGCQAHANICAAGTGVFLLIRRTTILLQRSARQSPWPSPYLDAFGEEDIEMRRGKPLYLNEERYAALSYMVACHGLDRNSKVLGQTTIGSVFVI |